A linha de pesquisa em Controladoria, por sua vez, tem por foco estudos e pesquisas sobre instrumentos de gestão necessários ao suporte do processo de planejamento e controle das organizações, bem como a avaliação do desempenho econômico dos negócios. A linha compreende conteúdos voltados para a Contabilidade de Custos, Contabilidade Gerencial, Controladoria, Contabilidade Decisorial, Comportamento Organizacional, Tecnologia da Informação, Métodos Quantitativos Aplicados à Contabilidade Gerencial, Gestão de Custos e Preços, Governança Corporativa e Educação Contábil.